Mutanti
Mutanti jsou vlastně lidi, kteří přišli o rozum. První mutant byl zaznamenán po neúspěšném vědeckém pokusu s experimentální drogou. Další mutanti vznikli neznámo jak, pravděpodobně jsou to stalkeři, kteří vlivem záření nebo drog přišli o rozum. Na druhou stranu jsou až neuvěřitelně odolní. Normální zbraně je sice zraní, ale nezabijí a po rychlé regeneraci se mutanti vrací zpět ke stalkerům a loví.
Pár stalkerů se je snažilo uplatit jídlem, někdy to vyšlo, jindy ne, obvykle mutant nezaútočí, pokud se stalker nepohybuje a nedrží zbraň.
Vědec a technik spolu vytvořili zbraň účinou proti mutantům, ta je momentálně u R.A.Gu.
Supermutanti
Supermutanti jsou uměle vytvoření mutanti, kteří kromě odolnosti disponují i lidským rozumem. Jednoho vyslal R.A.G. Corporation svrhnout Kapitána a tento supermutant (Komandér Kolja) měl převzít velení R.A.Gu a využít stalkery jako potravu pro další supermutanty. Toto se naštěstí nepovedlo a Kolja byl zabit. Také je známo, že supermutanti umí komunikovat s normálními mutanty a částečně je ovládat.
Také rádi jedí lidské maso.
Supermutanty lze rozeznat pouze podle obličeje, jinak vypadají a chovají se jako lidé. Proto obvykle nosí masky.